Целью деятельности Администрации является обеспечение безопасности мореплавания в морских портах и на подходах к ним. Предметом деятельности Администрации является обеспечение организационного, материально-технического и финансового исполнения капитанами морских портов Охотского моря и Татарского пролива своих функций в соответствии с законодательством Российской Федерации. Зоной ответственности АМП являются морские порты Магаданской области и Хабаровского края: Магадан, Охотск, Николаевск-на-Амуре, Мыс Лазарева, Де-Кастри, Ванино, Советская Гавань.