ФБУ «Росавтотранс» является компетентным органом Министерства транспорта Российской Федерации в области автомобильного транспорта при реализации обязательств, вытекающих из международных договоров Российской Федерации по перевозкам скоропортящихся пищевых продуктов, опасных грузов, а также касающихся работы экипажей транспортных средств, производящих международные автомобильные перевозки (ЕСТР). Ведомство проводит Смешанные комиссии с Министерствами транспорта других государств, где отстаиваются права российских перевозчиков, согласовываются контингенты разрешений на перевозки.